گروه فیلوژنی اشریشیا کلی‌های جدا شده از جوجه بلدرچین‌های ژاپنی سپتی‌سمیک در اهواز

نوع مقاله: مقاله کامل

نویسندگان

1 استادیار بهداشت و بیماری‌های طیور، دانشکده دامپزشکی دانشگاه شهید چمران اهواز

2 دانشجوی دکترای تخصصی بهداشت و بیماری‌های طیور، دانشکده دامپزشکی دانشگاه شهید چمران اهواز

3 دانشیار میکروبیولوژی، دانشکده دامپزشکی دانشگاه شهید چمران اهواز

4 استاد بهداشت و بیماری‌های طیور، دانشکده دامپزشکی دانشگاه شهید چمران اهواز

5 استاد میکروبیولوژی، دانشکده دامپزشکی دانشگاه شهید چمران اهواز

6 فارغ‌التحصیل دوره عمومی دانشکده دامپزشکی دانشگاه شهید چمران اهواز

چکیده

بهداشت مناسب، مرگ و میر را در کلیه مراحل رشد بلدرچین در سطح پایین نگه می‌دارد. یکی از مهم‌ترین علت‌های مرگ و میر در جوجه‌های نوزاد، عفونت‌های باکتریایی می‌باشد. باکتری اشریشیاکلی یکی از مهم‌ترین عوامل بیماری‌زای جدا شده در جوجه بلدرچین‌های ژاپنی سپتی- سمیک است. این میکروارگانیسم انتشار جهانی داشته و جزء فلور طبیعی دستگاه گوارش در انسان و حیوانات است. این مطالعه به منظور شناسایی گروه ژنوتیپی اشریشیا کلی‌های جدا شده از بلدرچین‌های سپتی‌سمیک در مزارع بلدرچین صنعتی اطراف اهواز بر اساس حضور یا عدم حضور 3 ژن chuA ،yjaA و TspE4.C2 انجام گرفت. بدین منظور  DNA بیست و نه جدایه اشرشیا کلی استخراج و با استفاده از سه زوج پرایمر اختصاصی حضور سه ژن مذکور به روش زنجیره پلیمراز چندتایی (Multiplex PCR) بررسی شد. بررسی فیلوژنتیکی 29 جدایه‌ی اشریشیاکلی ‌بلدرچین توزیع این جدایه‌ها را در چهار گروه فیلوژنتیکی (48/34) A، (24/17) B1، (35/10) B2 و (58/27) D نشان داد. بیشترین فراوانی در گروه فیلوژنی A مشاهده شد.

کلیدواژه‌ها

موضوعات


عنوان مقاله [English]

Phylogenic groups of E. coli isolated from septicemic Japanese quail in Ahvaz

نویسندگان [English]

  • Z. Boroomand 1
  • R. Zare 2
  • D. Gharibi 3
  • R. Jafari 4
  • M. Gorbanpour 5
  • K. Kazemi 6
1 Avian Health and Diseases, Faculty of Veterinary Medicine, ShahidChamran University of Ahvaz, Ahvaz-Iran.
2 Avian Health and Diseases, Faculty of Veterinary Medicine, ShahidChamran University of Ahvaz, Ahvaz-Iran.
3 Microbiology, Faculty of Veterinary Medicine, ShahidChamran University of Ahvaz, Ahvaz-Iran.
4 Avian Health and Diseases,Faculty of Veterinary Medicine, ShahidChamran University of Ahvaz, Ahvaz-Iran.
5 Microbiology, Faculty of Veterinary Medicine, ShahidChamran University of Ahvaz, Ahvaz-Iran
6 DVM graduated student of Faculty of Veterinary Medicine, ShahidChamran University of Ahvaz, Ahvaz-Iran
چکیده [English]

Suitable hygiene keeps low mortality rates in all quail growth stages. One of the most important causes of death in newborns is bacterial infections. Escherichia coli is one of the most important microbial agents in septicemic Japanese quail chicks. It has a global distribution and is part of the natural flora of the digestive system in human and animals.Phylogenetic study indicated that the great majority of E. coli strains can be classified into one of the four phylo-groups (A, B1, B2, and D). This study was conducted to identify the phylogenic groups of E. coli isolated from septicemic Japanese quail in Ahvaz based on the presence or absence of three genes (chuA, yjaA and TspE4.C2). For this purpose, the DNA of 29 isolates of E. coli was extracted and tree mentioned genes were detected by multiplex polymerase chain reaction (Multiplex PCR). The isolates belonged to four main phylo-groups, including 34.48% isolates to A, 17.27%to B1, 10.35% B2 and 27.58% to D. The highest frequency was observed in the phylogenetic group A.

کلیدواژه‌ها [English]

  • E. coli
  • phylo-groups
  • Japanese quail
  • Multiplex PCR

1. Akond, M.A., Alam, S., Hassan, S.M.R., and Shirin, M. 2009. Antibiotic resistance of Escherichia coli isolated from poultry and poultry environment of Bangladesh. Internet Journal of food safety 11: 19-23.
2. Bergthorsson, U., and Ochman, H. 1998. Distribution of chromosome length variation in natural isolates of Escherichia coli. Molecular Biology and Evolution 15(1): 6-16.
3. Clermont, O., Bonacorsi, S., and Bingen, E. 2000. Rapid and simple determination of the Escherichia coli phylogenetic group. Applied and Environmental Microbiology 66(10): 4555-4558.
4. Dissanayake, D.R.A., Wijewardana, T.G., Gunawardena, G.A., and Poxton, I.R. 2008. Distribution of lipopolysaccharide core types among avian pathogenic Escherichia coli in relation to the major phylogenetic groups. Veterinary Microbiology 132(3): 355-363.
5. Escobar-Paramo, P., Grenet, K., Le Menac'h, A., Rode, L., Salgado, E., Amorin, C., Gouriou, S., Picard, B., Rahimy, MC., Andremont, A., Denamur, E., and Ruimy, R. 2004. Large-scale population structure of human commensal Escherichia coli isolates. Applied and Environmental Microbiology 70: 5698–5700.
6. Escobar-Páramo, P., Menac’h, L., Gall, T., Amorin, C., Gouriou, S., Picard, B., and Denamur, E. 2006. Identification of forces shaping the commensal Escherichia coli genetic structure by comparing animal and human isolates. Environmental microbiology 8(11): 1975-1984.
7. Ewers, C.G., Li, H., Wilking, S., Kiessling, K., Alt, E.M., Anta´o, C., Laturnus, I., Diehl, S., Glodde, T., Homeier, U., Bo¨hnke, H., Steinru¨ck, H., Philipp, C., and Wieler, L.H. 2007. Avian pathogenic, uropathogenic, and newborn menin-gitis-causing Escherichia coli. International Journal of Medical Microbiology 297: 163–176.
8. Girardeau, J.P, Dalmasso, A., Bertin, Y., Ducrot, C., Bord, S., Livrelli, V., Vernozy-Rozand, C., and Martin, C. 2005. Association of virulence genotype with phylogenetic background in comparison to different seropathotypes of Shiga toxin-producing Escherichia coli isolates. Journal of Clinical Microbiology 43: 6098–6107.
9. Gordon, D.M., and Cowling, A. 2003. The distribution and genetic structure of Escherichia coli in Australian vertebrates: host and geographic effects. Microbiology (2003), 149, 3575–3586.
10. Johnson, J.R., Delavari, P., Kuskowski, M., and Stell, A.L. 2001. Phylogenetic distribution of extraintestinal virulence-associated traits in Escherichia coli. Journal of Infectious Diseases 183(1): 78-88.
11. Kazemi, K. 2015. An investigation into enterobacteriaceal agents responsible for early mortality in Japanese quail chicks and their antibiotic susceptibility patterns. DVM thesis. ShahidChamran University of Ahvaz, Iran. (In Persian).
12. Khan, K.A., Khan, S.A., Aslam, A., Rabbani, M., and Tipu, M.Y. 2004. Factors contributing to yolk retention in poultry: a review. Pakistan Veterinary Journal 24 (1): 46–51.
13. Livermore, D.M. 1998. β–Lactamases-mediated resistance and apportunities for its control. Journal of Antimicrobial Chemotherapy 41(4): 25-41.
14. Maleki, E. 2015. Detection of antimicrobial resistance genes and its relation to phylogenetic groups in Escherichia coli isolated from healthy and septicemic broiler chickens in Ahwaz. Ph.D thesis. ShahidChamran University of Ahvaz, Iran. (In Persian).
15. Nain, S., and Smits, J. E.G. 2011. Validation of a disease model in Japanese quail (Coturnixcoturnix japonica) with the use of Escherichia coli serogroup O2 isolated from a Turkey. Can J Vet Res 75(3): 171–175.
16. Picard, B., Garcia, J.S., Gouriou, S., Duriez, P., Brahimi, N., Bingen, E., and Denamur, E. 1999. The Link between Phylogeny and Virulence in Escherichia coli Extraintestinal Infection. Infection and Immunity 67(2): 546-553.
17. Rodriguez-Siek, K.E., Giddings, C.W., Doetkott, C., Johnson, T.J., Fakhr, M.K., and Nolan, L.K. 2005. Comparison of Escherichia coli isolates implicated in human urinary tract infection and avian colibacillosis. Microbiology 151(6): 2097-2110.
18. Saif, Y.M., and Eterradossi, N. 2008. Infectious bursal disease.pp. 153-184, In: Disease of Poultry. Saif, Y.M., Fadly, A.M., Glisson, J.K., Mcdouglad, L.R., Nolan, L.K., and Swayne. DE.12th Edition. Blackwell Publishing Professional. Ames, Iowa, U.S.A.
19. Salehi, M., and Ghanbarpour, R. 2010. Phenotypic and genotypic properties of Escherichia coli isolated from colisepticemic cases of Japanese quail. Tropical Animal Health and Production 42(7): 1497-1504.
20. Sheibani, H. 2011. Identification of fememberia factors in the Escherichia coli isolated from general cases of Quebec colisepticemic. Ph.D. thesis. ShahidBahonar University of Kerman, Iran. (In Persian).
21. Skurnik, D., Ruimy, R., Andremont, A., Amorin, C., Rouquet, P., Picard, B., and Denamur, E. 2006. Effect of human vicinity on antimicrobial resistance and integrons in animal faecal Escherichia coli. Journal of Antimicrobial Chemotherapy 57(6): 1215-1219.
22. Smith, J.M., Smith, N.H., O'Rourke, M., and Spratt, B.G. 1993. How clonal are bacteria. Proceedings of the National Academy of Sciences 90(10): 4384-4388.