@article { author = {Banabazi, M.H. and Farhangfar, H. and Behdani, E.}, title = {RNA-Sequencing, integrated networking, myogenesis}, journal = {Veterinary Research & Biological Products}, volume = {31}, number = {2}, pages = {120-127}, year = {2018}, publisher = {Razi Vaccine & Serum Research Institute}, issn = {2423-5407}, eissn = {2423-5415}, doi = {10.22092/vj.2018.116827.1410}, abstract = {RNA-Sequencing technique is a powerful tool for analysis of cellular transcriptome in many research areas. In recent years, network constructing on data resulted from this technique and gene relationships have been investigated for better understanding the complex physiological mechanisms. In this study, construction of gene regulatory network and surveying gene relationships which involve in skeletal muscle synthesis were discussed by growing muscle tissue’s RNA-Seq data. This research introduced six transcription factors which were involved in formation and growth of skeletal muscle tissue by fitting an integrated network. These transcription factors included KLF4, FOXM1, FOS, MYBL2, KLF10 and FOSB. Their biological roles have been identified in proliferation and differentiation of stem cells, elongation and fusion of muscle cells, myofibril generation and self-renewal of satellite cells. Ontology of these transcription factors and their regulated genes showed that theyare involved in hexose pathway and nucleotides production. Theyare also involved in regulation of basic cell activities such as gene expression and transcription. These genes may be used as molecular markersfor improvement of meat production in breeding programs.}, keywords = {RNA-Sequencing,integrated networking,myogenesis}, title_fa = {کاربرد شبکه‌های تلفیقی به منظور برازش شبکه تنظیم بیان ژنی مؤثر بر رشد ماهیچه اسکلتی در گاو}, abstract_fa = {فناوری توالی‌یابی رونوشت‌های سلولی ابزار قدرتمندی در جهت تجزیه و تحلیل رونوشت‌های سلولی، در بسیاری از زمینه‌های تحقیقاتی می‌باشد. در سال‌های اخیر پیاده‌سازی شبکه جهت بررسی روابط بین ژن‌ها با استفاده از داده‌های حاصل از این فناوری به درک بهتر سازوکارهای پیچیده فیزیولوژیکی کمک نموده است. در این مطالعه به ساخت شبکه تنظیم بیان ژن و مطالعه روابط بین ژن‌های دخیل در تشکیل و رشد بافت ماهیچه اسکلتی به کمک توالی‌یابی رونوشت‌ها در بافت ماهیچه‌ای در حال رشد، پرداخته شده است. این پژوهش با پیاده‌سازی شبکه تلفیقی بر روی داده‌های ذکر شده، شش فاکتور رونویسی دخیل در تشکیل و رشد بافت ماهیچه اسکلتی را معرفی کرده است. این شش فاکتور رونویسی عبارتند از KLF4 ،FOXM1 ،FOS ،MYBL2 ،KLF10 و FOSB. نقش این فاکتورهای رونویسی در فرایند‌هایی مانند تکثیر سلول‌های بنیادی و تمایز آنها، افزایش طول و امتزاج سلول‌های ماهیچه‌ای، تکمیل مرحله تمایز و امتزاج سلول‌های فیبر ماهیچه و تولید میوفیبر و کمک به حفظ خاصیت خودزایایی در سلول‌های بنیادی بافت ماهیچه اسکلتی مشخص شده است. هستی‌شناسی مربوط به این فاکتور‌های رونویسی و ژن‌هایی که بیانشان تحت تأثیر این فاکتور‌های رونویسی تغییر می‌کند، نشان داد که این ژن‌ها در مسیرهای تولید هگزوز و نوکلئوتیدها فعال هستند. این ژن‌ها در تنظیم فعالیت‌های پایه‌ای سلول مانند تنظیم بیان ژن و رونویسی نیز دخالت داشتند. از این ژن‌ها می‌توان به عنوان نشانگر مرتبط با افزایش تولید گوشت در برنامه‌های اصلاح نژادی بهره برد.}, keywords_fa = {فناوری توالی‌یابی نسل جدید,شبکه تلفیقی,میوژنز}, url = {https://vj.areeo.ac.ir/article_115757.html}, eprint = {https://vj.areeo.ac.ir/article_115757_38443cf0d5c8c9e3aa4ccdcacd40d87f.pdf} }