@article { author = {Torabi, Nooshafarin and Mosavari, Nader and Nazari, Razieh}, title = {Molecular Identification of Mycobacterium tuberculosis Complex by RD-Typing and PCR-RFLP Method}, journal = {Veterinary Research & Biological Products}, volume = {30}, number = {3}, pages = {16-25}, year = {2017}, publisher = {Razi Vaccine & Serum Research Institute}, issn = {2423-5407}, eissn = {2423-5415}, doi = {10.22092/vj.2017.109886}, abstract = {Tuberculosis is still considered as one of the most important zoonotic diseases and the cause of infectious death and human casualties. The main purpose of this study was to set up and diagnose Mycobacterium tuberculosis complex isolates in patients of FARS, Shiraz using the Regions of Difference (RD) typing and RFLP techniques. The genomes of 50 isolates were extracted by boiling method. To determine the genus of the isolates, PCR technique based on 16 s rRNA was used. IS6110 PCR and RD typing were used for the detection of Mycobacterium tuberculosis complex. Finally, the PCR-RFLP method was used as a comparing method for comparative evaluation of RD typing to identify mycobacteria. Amplification of 543 bp bands in 16s rRNA PCR showed that all studied isolates belonged to the genus Mycobacterium. In IS6110 gene PCR, it was shown that all isolates were Mycobacterium tuberculosis complex due to the amplification of 245 bp bands. In RD typing the identification was based on RD1, RD4, RD9 and RD12. The comparative method of PCR-RFLP on pseudo gene oxyR showed that all isolates were Mycobacterium tuberculosis. Using RD-typing, it was found that all isolates achieved from Shiraz were Mycobacterium tuberculosis. The absence of Mycobacterium bovis isolates represents good hygiene and consumption of pasteurized milk in this city. The results of this study also reflect the ability of RD typing technique in differentiation of mycobacteria.}, keywords = {Mycobacterium tuberculosis complex,RD-Typing,PCR 16s rRNA,IS6110}, title_fa = {تعیین هویت مولکولی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس کمپلکس در بیماران استان فارس به وسیله تکنیک های RD Typing و PCR-RFLP}, abstract_fa = {بیماری سل، بیماری زئونوزی است که به عنوان یکی از مهم‌ترین بیماری‌های تهدید کننده انسان و دومین عامل عفونی در انسان می‌باشد. تمایز گونه‌های مختلف کمپلکس مایکوباکتریوم توبرکلوزیس به روش‌های معمول زمان برو از طرفی، تشخیص دقیق جهت درمان به موقع بیماران، نقش حیاتی را ایفا می‌نماید. لذا هدف از این مطالعه، شناسایی جنس مایکوباکتریوم و تعیین هویت مولکولی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس کمپلکس در بیماران استان فارس به وسیله تکنیک‌های RD typing و PCR-RFLP بود. ژنوم 50 جدایه با استفاده از روش جوشاندن استخراج گردید. برای تعیین جنس این جدایه‌ها از تکنیک PCR بر اساس قطعه 16S rRNA استفاده گردید. تکنیک PCR IS6110 و تکنیکRD typing نیز به ترتیب برای شناسایی و تعیین هویت باکتری مورد استفاده قرار گرفت. در نهایت، با استفاده از تکنیک‌های RD typing و PCR-RFLP بر روی ژن oxyR جهت تعیین هویت مایکوباکتریوم‌/تعیین گونه مایکوباکتریوم انجام شد. تمامی جدایه‌ها با استفاده از تکنیک PCR برای16S rRNA باند 543 جفت باز را نمایش دادند و با استفاده ازPCR برایIS6110، باند 245 جفت باز را نمایش دادند که مایکوباکتریوم توبرکلوزیس کمپلکس را اثبات کردند. در تعیین هویتRD typing،RD1، RD4، RD9 و RD12 به ترتیب باندهای 146،172،235و 365 شناسایی شدندکه مشخص شد تمامی جدایه‌های مورد مطالعه گونه توبرکلوزیس می‌باشند. با استفاده از تکنیک PCR-RFLP روی ژن کاذب oxyR هویت مولکولی RD typing تایید شد. نتایج در این مطالعه نیز نشان‌دهنده قدرت تکنیک RD typing درتمایز بین مایکوباکتریوم‌ها می‌باشد و مشخص گردید تمام جدایه‌های ارسالی از شیراز، مایکوباکتریوم توبرکلوزیس هستند و مایکوباکتریوم بویس مشاهده نشد. عدم وجود گونه بویس در جدایه‌های ارسالی از شهر شیراز، نشان‌دهنده بهداشت مناسب شیر پاستوریزه در این شهر می‌باشد.}, keywords_fa = {کمپلکس مایکوباکتریوم توبرکلوزیس,RD typing,PCR16S rRNA,S6110}, url = {https://vj.areeo.ac.ir/article_109886.html}, eprint = {https://vj.areeo.ac.ir/article_109886_693458984a33f2f83227a745221dabba.pdf} }